La microscopia confocale può essere eseguita su tutti, compresi i bambini e le donne in gravidanza.
Infatti, non essendo invasiva, non ha effetti collaterali. È una metodologia diagnostica rispettosa della pelle.
In seguito alla sua esecuzione non bisognerà avere nessuna accortezza specifica per la zona interessata.
L'unico limite di questo mezzo è che non può essere usato lì dove il vetrino adesivo non aderisce.